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NBDC 公開データ一覧
2023/8/17 時点
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| Research ID | 研究題目 | 提供者 | データID | 内容 | 公開日 |
|---|---|---|---|---|---|
| hum0014.v19 | オーダーメイド医療の実現プログラム | 久保 充明 | hum0014.v1.freq.v1 | 心筋梗塞1666症例および対照健常者3198名のGWAS | 2014/9/30 |
| hum0014.v2.jsnp.934ctrl.v1 | 健常者934名の遺伝子型カウント情報（JSNPのデータ） | 2015/12/28 | |||
| 35疾患 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報（JSNPのデータ） | 2015/12/28 | |||
| hum0014.v2.jsnp.182ec.v1 | 食道がん182症例の遺伝子型カウント情報（JSNPのデータ） | 2015/12/28 | |||
| hum0014.v2.jsnp.92als.v1 | 筋萎縮性側索硬化症92症例の遺伝子型カウント情報（JSNPのデータ） | 2015/12/28 | |||
| hum0014.v3.T2DM-1.v1 | ２型糖尿病9817症例および対照者6763名のGWAS | 2016/1/28 | |||
| hum0014.v3.T2DM-2.v1 | ２型糖尿病5646症例および対照者19,420名のGWAS | 2016/1/28 | |||
| hum0014.v4.AD.v1 | アトピー性皮膚炎患者1472症例および対照者7966名のGWAS | 2016/2/2 | |||
| hum0014.v5.AF.v1 | 心房細動患者8180症例および対照者28,612名のGWAS | 2017/5/18 | |||
| JGAS00000000101 | 心房細動患者8180症例のPhenotypeデータ、Genotypeデータ | 2017/5/18 | |||
| hum0014.v6.158k.v1 | 158,284名のBMIのGWAS | 2017/9/8 | |||
| JGAS00000000114 | 158,284名のBMIデータ、182,505名のGenotypeデータ | 2017/9/8 | |||
| hum0014.v7.POAG.v1 | 開放隅角緑内障3980症例および対照者18,815名のGWAS | 2018/4/4 | |||
| hum0014.v8.58qt.v1 | 162,255名の58臨床検査値のGWAS | 2018/5/1 | |||
| JGAS00000000114 | 162,255名の58臨床検査値のPhenotypeデータ | 2018/5/1 | |||
| hum0014.v9.Men.v1、hum0014.v9.MP.v1 | 初潮年齢データを有する女性67,029名および閉経年齢データを有する女性43,861名のGWAS | 2018/8/7 | |||
| JGAS00000000114 | BBJ第1コホート1026名のWGSデータ | 2018/8/13 | |||
| JGAS00000000140 | 乳がん7,104症例と対照者23,731名の遺伝性乳がん原因11遺伝子翻訳領域のTarget Capture Sequencingデータ | 2018/10/16 | |||
| hum0014.v12.T2DMwN.v1 | ２型糖尿病腎症2,809症例および２型糖尿病対照5,592症例のGWASメタ解析 | 2018/12/10 | |||
| hum0014.v13.T2DMmeta.v1 | ２型糖尿病36,614症例および対照者155,150名のGWASメタ解析 | 2019/1/25 | |||
| hum0014.v14.smok.v1 | 日本人集団165,436名における喫煙習慣のGWAS | 2019/3/26 | |||
| JGAS00000000114 | バイオバンクジャパン1037名のWGSデータと1000ゲノムプロジェクト（Phase3v5）2504名のWGSのvcfファイルを統合したgenotype imputation用のreference panel | 2019/9/27 | |||
| hum0014.v15.ht.v1 | 159,095名の身長のGWAS | 2019/9/27 | |||
| JGAS00000000203 | 遺伝性前立腺がん7,636症例と対照者12,366名の遺伝性前立腺がん原因8遺伝子翻訳領域のTarget Capture Sequencingデータ | 2019/10/7 | |||
| hum0014.v17 | 40疾患のGWAS | 2019/10/8 | |||
| hum0014.v18 | 乳がんのGWAS | 2019/11/26 | |||
| hum0014.v19 | 日本人集団165,084名における食習慣のGWAS | 2020/4/20 | |||
| hum0028.v2 | オーダーメイド医療の実現プログラム | 久保 充明（BBJ） | JGAS00000000018 | HLA領域（7座位）の遺伝子型情報およびHLAアリル情報 | 2015/6/2 |
| JGAS00000000018 | HLA-DQA1領域の遺伝子型情報およびHLA-DQA1アリル情報の追加 | 2018/6/5 | |||
| hum0036.v1 | 全エクソームキャプチャプラットフォーム間の性能比較 | 久保 充明 | DRA003736 | NGS (Exome) | 2015/8/1 |
| hum0099.v1 | ヒト免疫細胞における遺伝子多型と遺伝子発現の関連解析 | 山本 一彦 | JGAS00000000085 | RNA-seqによる遺伝子発現量データ（FPKM情報） | 2017/4/24 |
| hum0099.v1.eqtl.v1 | eQTL解析の結果：各varinatの対象遺伝子に対する統計量（effect size, P-value等）のまとめ | 2017/4/24 | |||
| hum0238.v1 | オーダーメイド医療開発プロジェクト | 桃沢 幸秀 | JGAS00000000240 | NGS（WGS）に内在するHHV-6配列 | 2020/7/28 |
| hum0229.v1 | 老化・神経疾患における分子マーカーの探索と分子基盤の解明 | Piero Carninci | JGAS00000000230 | NGS（scRNA-seq） | 2020/5/15 |
| hum0113.v1 | パーキンソン病の代謝産物バイオマーカー創出およびその分子標的機構に基づく創薬シーズ同定 | Piero Carninci | JGAS00000000119 | NGS（CAGE-seq） | 2020/4/24 |
| hum0163.v1 | 精神・神経疾患治療薬及びがん治療薬におけるファーマコゲノミクス研究 | 莚田 泰誠 | hum0163.v1.freq.v1 | NGS（Target Capture） | 2018/12/14 |
| hum0160.v2 | シークエンス解析によるがんゲノム研究：食道がん | 中川 英刀 | JGAS00000000155 | NGS（WGS） | 2019/5/28 |
| JGAS00000000155 にデータ追加 | NGS（WGS）のbam/gvcfデータ | 2021/7/13 | |||
| hum0158.v3 | シークエンス解析によるがんゲノム研究：肝臓がん | 中川 英刀 | JGAS00000000151 | NGS（WGS）、NGS（RNA-seq） | 2018/10/22 |
| JGAS00000000151 にデータ追加 | NGS（WGS） | 2019/6/21 | |||
| JGAS00000000151 にデータ追加 | NGS（WGS）のbam/gvcfデータ | 2021/7/13 | |||
| hum0132.v1 | ベトナムにおけるダイオキシン関連疾患のゲノムシークエンス解析 | 中川 英刀 | JGAS00000000137 | NGS（WGS） | 2018/9/7 |
| hum0103.v4 | シークエンス解析によるがんゲノム研究：胆道がん | 中川 英刀 | JGAS00000000109 | NGS（WGS）、NGS（Exome） | 2018/2/27 |
| JGAS00000000109 にデータ追加 | NGS（WGS） | 2019/6/21 | |||
| JGAS00000000109 にデータ追加 | NGS（WGS）のbam/gvcfデータ | 2021/7/13 | |||
| JGAS000389 | NGS（WGS）、NGS（Exome）、NGS（RNA-seq） | 2022/1/18 | |||
| hum0344.v2 | シークエンス解析によるがんゲノム研究：腎臓がん | 中川 英刀 | JGAS000533 | NGS（WGS）,NGS（RNA-seq） | 2022/8/4 |
| JGAS000611 | NGS（Amplicon-seq） | 2023/5/16 | |||
| hum0316.v1 | 食道がんの全ゲノムシークエンス解析による病態解明と治療感受性マーカーの探索に関する研究 | 中川 英刀 | JGAS000535 | NGS（WGS）,NGS（RNA-seq） | 2022/5/26 |
| hum0306.v1 | 国際連携によるがんゲノムシークエンス解析 （シークエンス解析によるがんゲノム研究） | 中川 英刀 | JGAS000361 | NGS（WGS） | 2021/10/15 |
| hum0161.v2 | シークエンス解析によるがんゲノム研究：肝芽腫 | 中川 英刀 | JGAS000156 | NGS（WGS） | 2021/6/4 |
| JGAD000688 | JGAD000234の加工データ | 2022/12/27 | |||
| hum0159.v2 | シークエンス解析によるがんゲノム研究：大腸がん | 中川 英刀 | JGAS000157 | NGS（WGS） | 2021/6/1 |
| JGAD000689 | JGAD000235の加工データ | 2022/12/27 |